徕卡数字显微镜和传统显微镜最大的不同，就是它没有目镜。观察的时候不需要把眼睛凑上去看，而是通过一台数码相机捕捉图像，直接在电脑或屏幕上显示。
它的基本工作流程是：把样本放在载物台上，相机在屏幕上显示实时画面。操作者通过鼠标或软件控制载物台移动、调节焦距和更换物镜。看到清晰的图像后，点击软件上的按钮就能把画面拍下来。
这种设计带来一个直接的好处：观察者的姿势更自然。用传统显微镜需要长时间低头弯腰，容易导致颈椎和背部疲劳。用数字显微镜可以像平时用电脑一样坐直身体，适合需要长时间工作的场景。
徕卡数字显微镜的软件负责很多工作。它可以在图像上直接进行测量，比如量长度、角度、面积。测量前需要先用一个标准刻度尺进行校准，校准数据会保存在软件里。之后拍下的每一张照片都会自动带上准确的尺寸信息。
软件还能把多张不同焦距的照片合成一张，让样本从前景到背景都清晰。这在观察表面不平整的物体时很有用，比如金属零件或昆虫标本。
它支持多种观察模式。明场模式用于观察染色样本。相差模式用于观察未染色的活细胞，利用细胞不同部位对光的折射差异产生对比度，不需要给细胞染色。荧光模式用于观察被荧光标记的特定结构。
徕卡数字显微镜有几种不同的软件平台。Enersight软件可以直接在显示器上运行，不需要连接电脑。它支持拍照、录像、测量和标注。Mateo系列显微镜的软件更简单，界面上有直观的按钮，从开机到拍出第一张照片只需要不到一分钟。
在生命科学领域，它被用来观察细胞培养的状态。软件可以自动计算细胞汇合度，也就是细胞长满了培养皿的百分之多少。这个功能省去了人工估算的时间。
在工业领域，它用于质量控制和缺陷分析。比如检查电路板上的焊点是否合格，或者分析金属断面的裂纹形态。拍下的照片可以直接放进检测报告里，照片上带有准确的尺寸标注。
徕卡数字显微镜的相机传感器基于光电效应工作。光线照射到传感器上，光子被转换成电子，电子再被转换成数字信号。传感器的像素大小和数量决定了图像的分辨率。
它还可以把图像通过U盘导出，或者通过无线网络发送到手机上。部分型号支持多人同时观看屏幕上的画面，方便团队讨论。
徕卡数字显微镜把传统显微镜的光学部分和数字成像、软件分析结合在一起。它让显微观察变成了一种标准化的数字工作流程。
